Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfap2eQ6VUP9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms