Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms