Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms