Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbtb39Q6PDK0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms