Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Papd7Q6PB75 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Papd7Q6PB75 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms