Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms