Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smchd1Q6P5D8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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