Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms