Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms