Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ctnna3Q65CL1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna3Q65CL1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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