Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcncQ62447 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcncQ62447 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcncQ62447 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcncQ62447 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms