Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms