Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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