Protein–RNA interactions for Protein: Q61089

Fzd6, Frizzled-6, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd6Q61089 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fzd6Q61089 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fzd6Q61089 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms