Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms