Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms