Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms