Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trappc1Q5NCF2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Trappc1Q5NCF2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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