Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms