Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms