Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms