Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Esf1Q3V1V3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Esf1Q3V1V3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Esf1Q3V1V3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Esf1Q3V1V3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Esf1Q3V1V3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms