Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3V0E1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms