Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sec31aQ3UPL0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms