Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms