Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms