Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms