Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms