Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms