Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms