Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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