Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms