Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms