Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms