Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms