Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms