Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms