Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1bP97358 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms