Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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