Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms