Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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