Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx1P81068 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms