Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx2P81066 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms