Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf3P70671 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms