Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeboxP70368 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms