Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab3cP62823 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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