Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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