Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms