Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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P58686 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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P58686 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P58686 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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P58686 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P58686 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P58686 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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