Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms